在水性地坪漆涂料生產過程中，樹脂溶液、溶劑、顏料和填料等通過吸入或皮膚接觸會對人體組織產生作用。生產水性地坪漆涂料主要使用親水性物質，限制使用親油性物質，所以由于脂肪溶解作用而產生的皮膚發紅和炎癥的危險性已經大大下降。同時接觸涂料的皮膚和衣服只需經過肥皂和水的簡單清洗就可以除去。但如果單獨接觸某一組分則仍然可能受到傷害，這跟傳統涂料是相同的，所以一定要小心，像加入胺時就需要特別小心，因為其毒性比一般的溶劑還要大。
接觸溶劑時也要采取同樣的保護措施，這是每一個涂料工程師都知道的，而這也正是顯示水基涂料最大的優點，其有機溶劑的含量比溶劑涂料低得多，所以水性地坪漆要保持閡限值（TLV）是很容易的。同樣，水性地坪漆的貯存危險性也小得多，對貯存的安全保護相應地也就沒有那么高的要求。
水性地坪漆不像其他傳統涂料那樣被列為有害健康的產品，只要遵守一般的原則，其危險性和對健康的危害比傳統涂料要小得多。其中的原因主要是溶劑的含量已經大大降低，而涂料的危險和危害也恰恰來自其中所含的溶劑。但僅僅如此，還不足以使我們可以不加選擇地使用水稀釋涂料，特別是不能忽略其仍然存在的某些危險。如果通風不夠，就會導致噴涂時產生的漆霧被人吸入。漆霧在肺中積聚就會產生膠結物。由于水性地坪漆涂料的組成十分復雜，所以這樣的膠結作用對任何人來說都是不利于健康的。同樣水性地坪漆中的組分也會通過皮膚的吸附作用進人人體組織中，因此必須保護皮膚使其少接觸水溶性樹脂涂料。盡管水稀釋涂料在職業衛生方面是比較安全的，但仍要注意噴涂時要戴上防護面罩，在灌裝和稀釋時要戴手套。這樣，才算做好了完整的保護措施。