無菌實驗室的規劃和設計很重要
無菌實驗室也叫無菌試驗室，主要用于生物化學、生物醫學、微生物學、動物實驗、基因重組以及生物制品等研究使用的實驗室，統稱潔凈實驗室。組成：無菌實驗室由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養室和普通實驗室六部分組成。這些房間的共同特點是要求地板和墻壁的質地光滑堅硬，儀器和設備的陳設簡潔，便于打掃衛生。
無菌凈化內外間要求：無菌實驗室應有內、外兩間，內間是無菌室，外間是緩沖室。所有的房間面積不宜過大，吊頂不宜過高，要便于空氣滅菌。安全要求：無菌試驗室、生物安全實驗室必須保證人身安全、環境安全、廢棄物安全和樣本安全，能長期而安全地運行，同時還需要為實驗室工作人員提供一個舒適而良好的工作環境。
無菌實驗室應每次使用前后用0.1%苯扎溴銨溶液或2%甲醛液擦拭工作臺面及可能污染的死角，濕拖地面，打開無菌空氣過濾器及超凈工作臺的開關30分鐘，紫外線殺菌燈照射1小時。操作人員用肥皂洗手后進入緩沖間換拖鞋，用75%酒精棉球擦手，穿戴工作衣帽、口罩。將所需物品剝去牛皮紙及外包裝，從傳遞窗移入操作間，再用0.1%苯扎溴銨溶液泡手后進入操作間，在酒精(或煤氣燈)火焰區(火焰高度3-5cm)操作。
操作者不得用嘴直接吸吹吸管，防止致病菌感染操作人員及口中的雜菌污染供試品。供試品表面消毒，如為安瓿先用砂輪劃痕后用2%碘酒棉球擦拭，再用75%酒精棉球擦拭、待干，也可以用消毒液浸泡消毒。注射器如需回抽時，應對著火焰吸入無菌空氣。
潔凈實驗室是一個全密閉的環境，通過空調送、回風系統的初、中、高效過濾器，使室內環境空氣不斷循環過濾，以保證空氣懸浮粒子受控到一定濃度，潔凈實驗室需控制的主要參數有塵埃粒子數、菌落數、換氣次數、壓差、溫度、濕度、光照度、噪音。不論外在的空氣條件如何變化，潔凈室室內均能具有維持原先所設定要求的潔凈度、溫濕度及壓力等性能的特性。