一般設置在微生物實驗室內都需要無菌凈化
無菌實驗室也叫無菌試驗室，主要用于生物化學、生物醫學、微生物學、動物實驗、基因重組以及生物制品等研究使用的實驗室，統稱潔凈實驗室。無菌實驗室由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養室和普通實驗室六部分組成。這些房間的共同特點是要求地板和墻壁的質地光滑堅硬，儀器和設備的陳設簡潔，便于打掃衛生。
無菌凈化實驗室應有內、外兩間，內間是無菌室，外間是緩沖室。所有的房間面積不宜過大，吊頂不宜過高，要便于空氣滅菌。無菌試驗室、生物安全實驗室必須保證人身安全、環境安全、廢棄物安全和樣本安全，能長期而安全地運行，同時還需要為實驗室工作人員提供一個舒適而良好的工作環境。
無菌實驗室設計的各項建筑物應堅固耐用、易于維修、易于清潔，并具備能防止食品、食品接觸面及內包裝材料遭受污染(如有害動物的侵入、棲息、繁殖等)的結構。為防止交叉污染，應分別設置人員通道及物料運輸通道，人員通道應按潔凈室通道要求嚴格執行，各通道應裝有空氣幕(即風幕)或雙向彈簧門及電子滅蠅(蚊)器等防蟲設施。
須將通向外界的管路、門窗和通風道四周的空隙完全填充，所有窗戶、通風口和風機開口均應裝上防護網。無菌實驗室的高度應能滿足工藝、衛生要求，以及設備安裝、維護、保養的需要。
無菌實驗室一般設置在微生物實驗室內，室內室外裝備的換氣設備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環境和無菌材料后，只有保持無菌狀態，才能對某種特定的已知微生物進行研究。所以控菌能力和控菌穩定性是無菌室的核心驗收指標。業內通行的驗收標準為100級潔凈區平板雜菌數平均不得超過1個菌落，10000級潔凈室平均不得超過3個菌落，在通行標準之外，還應該定期保養與維護。只有建設時合理的選材指標，合適凈化等級和長期管理與維護，才能使無菌實驗室發揮其應有的作用。