無菌凈化潔凈室設計充分利用現有的空間，根據國家相關規范和試驗場所的特殊要求進行潔凈室平面布置。考慮生物安全實驗室應同事實施一級屏障和二級屏障的要求，其中一級屏障主要體現在微生物實驗區的平面布置和維護結構方面，二級屏障主要體現在空調凈化系統方面。
在平面布置方面把人流和物流分隔開，放置任何物的交叉感染：實驗操作人員通過一更緩沖間和二更緩沖間進入P2主實驗室；實驗物體通過兩個互鎖式傳遞窗進出P2主實驗室，其中一個互鎖式傳遞窗設在主實驗室和準備間之間，另外一個設在主實驗室和洗刷消毒室之間，保證了潔凈物不受感染，同時保證了污染物盡快傳進洗刷消毒室進行消毒滅菌。
無菌凈化規范中潔凈度最重要的指標就是地面的抗磨耗性，抗磨耗性越好，地面的析塵量也越低，所能達到的潔凈級別越高。關于材料的選擇，一般應按以下指標選擇：高級別潔凈場所（100一1000級），采用不析塵或弱析塵材料；析塵量較大的材料可用于低級別潔凈場所（10萬一百萬級）；而強析塵材料不能用于有潔凈要求的場所。
潔凈廠房送風通常使用高效送風口，高效送風口為千級、萬級、十萬級凈化空調系統較為理想的終端過濾裝置，可廣泛于醫藥、衛生、電子、化工等行業的凈化空調系統。高效送風口是用作改造和新建1000-300000級各級潔凈室的終端過濾裝置，是滿足凈化要求的關鍵設備。高效送風口包含靜壓箱，散流板，高效過濾器。
連接方式：與風管的接口可為頂接或側接。頂接就是接口位置在靜壓箱的頂部，側接的接口位置在靜壓箱的側部，側接比頂接將節省更多的豎向空間，不如氣流組織不如頂接的好。接口的方式可分為圓形和方形，可根據需求定制需要的風口。