對工業冷水機組故障的處理必須嚴格遵循科學的程序辦事，切忌在情況不清、故障不明、心中無數時就盲目行動，隨意拆卸工業冷水機。這樣做的后果往往會使工業冷水機已經發生的故障擴大化，或者引起新的故障，甚至會對工業冷水機造成嚴重損害。
如果企業正在運行中的工業冷水機出現故障，首先應該對機組進行關機處理，然后細致認真的進行現場檢測，了解工業冷水機在故障發生時各個部分的工作狀況，確定是工業冷水機的哪個部位發生故障，以及它的損壞程度是怎樣。
確定故障發生的經過并對其采取緊急措施后，企業的工業冷水機操作員應該及時與供貨的工業冷水機廠取得聯系，詳細告知故障部位及故障狀況。工廠安排的工業冷水機維修技術員到達現場后，可以對雖然有故障，但還可以在短時間內運轉，不會使故障進一步惡化的工業冷水機或者輔助裝置親自啟動操作，為正確分析故障原因掌握準確的感性認識依據。
此外，可以通過檢查工業冷水機的運行記錄表來分析故障發生的原因。特別是要重視記錄表中不同常態的運行數據和發生過的問題，以及更換或維修過的零件的運轉時間和可靠性，了解因為任何原因引起過的安全保護停機等情況，這些與故障發生有著密切的關系，尤其不能忽視。
如果企業要確保工業冷水機能夠正常、安全、穩定的長期運行，在條件允許的情況下，可以多配置一臺工業冷水機作為備用，即使其中的一臺工業冷水機因為長時間運轉導致不可避免的故障發生，還可以啟動備用的工業冷水機進行工作，不會影響企業對制冷的需求。
當然，較重要的是：企業一定要對工業冷水機組進行定期的清洗、維護保養工作。因為不管是任意一種機器設備，各個組件因長時間的聯軸運轉或摩擦，對機組勢必會造成一定程度的磨損，自然就會導致故障發生。